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写在前面准备工作Gaussian 安装Gaussview 安装实例测试

写在前面

最近老板让用 Gaussian 算一些东西，并用 Gaussview 看个电荷分布，再用 Multiwfn 画一下分子轨道。但自己的设备是 MacOS，不太好装 Multiwfn，于是打算虚拟一个 Linux，在 Linux 下装这几款软件。不过实际上我没装虚拟机，而是使用了组里 Linux 服务器自带的图形界面。没有服务器的话，装一个带图形界面的 Ubuntu 或 CentOS 即可，本质上是一样的，这里记录下安装过程供参考。

网上相关的教程其实很多，多看几个跟着操作一编基本上都能装上，但很多步骤是冗余的，如 <code>$PATH

之类的变量的手动设置完全可以省去。本文的只进行必要的操作步骤，快速简洁地进行这些软件的安装和配置。

准备工作

Linux 系统包含多种 shell，本文使用的是 bash。查看当前 shell:

echo $SHELL

显示：

/bin/bash

则说明使用的是 bash。

cd ~或 cd前往当前用户主目录。若不知道当前处于什么位置，使用 pwd查看，一般用户主目录为：

/.../home/[用户名]

以 .开头的文件是隐藏文件，每个用户主目录下会有一个隐藏文件 .bashrc存放了每当登录终端时自动执行的命令。使用 ls -a可以查看隐藏文件。

Gaussian 安装

先将 Gaussian (我的是 Gaussian16，Gaussian09 同理) 的压缩包解压在用户主目录 /.../home/[用户名]下，比如我的是 /work/home/wsmrt33，压缩文件是 .tbz格式，那么使用如下命令解压：

tar -jxvf G16-A03-AVX2.tbz

Linux 解压缩命令

创建存放中间文件的目录，例如:

mkdir /work/home/wsmrt33/g16/scratch

输入如下命令打开 .bashrc(代表使用 vi 编辑器打开主目录 ~下的 .bashrc文件，当前已处于用户主目录则无需 ~/)：

vi ~/.bashrc

在文件的最后插入 (使用大写 G 命令 (shift+g) 前往文件结尾处，输入 i 对文本进行插入。)：

export g16root=/work/home/wsmrt33

export GAUSS_SCRDIR=/work/home/wsmrt33/g16/scratch

source /work/home/wsmrt33/g16/bsd/g16.profile

这三行分别代表：

声明 Gaussian 目录的位置声明 (Gaussian 运行过程中产生的) 临时文件夹位置执行 Gaussian 自带脚本配置运行环境

插入完成后输入 :wq保存退出。

输入如下命令来重新进入终端使得命令生效：

source ~/.bashrc

进入 /work/home/wsmrt33/g16，运行：

chmod 750 -R *

输入：

g16

若显示：

Entering Gaussian System, Link 0=g16

说明 Gaussian 安装成功！

代表给当前目录下所有文件和目录下包含的文件设置权限。

参考：http://sobereva.com/439

Gaussview 安装

先解压 Gaussview 的安装包在主目录，我的压缩文件是 zip格式，那么使用如下命令解压：

unzip gv6.zip

进入 gv6目录输入：

./gview.sh

顺利打开则说明安装成功：

打开 <code>.bashrc：

vi ~/.bashrc

在最后加入：

alias gv6='/work/home/wsmrt33/g16/gv/gview.sh'code>

输入 :wq保存退出后，输入：

source ~/.bashrc

重新进入终端使得命令生效。然后输入 gv6，顺利打开则说明 Gaussview 配置成功！这时再任意目录下使用类似下面的命令：

gv6 ./test.gjf

即可用 GaussView 打开任意目录下的 .gjf文件。

实例测试